安装R
1.下载安装R
# /home/wangwz/packages/R/R-4.3.1下载安装R4.3.1
wget http://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/src/base/R-4/R-4.3.1.tar.gz
tar -zxvf R-4.3.1.tar.gz
cd R-4.3.1
# 注:R-4.0 以上在 configure 时,需要增加一个 --with-pcre1 参数。
./configure --with-readline=no --with-x=no --with-pcre1 --prefix=/home/wangwz/packages/R/R-4.3.1
make
make install
注:
安装其他低版本的R语言时,可能会遇到:error: libcurl >= 7.28.0 library and headers are required with support for https。
- 如果不必构建该版本,那么最简单的解决方案就是切换到 4.3.0 或更高版本(理想情况下是 4.3.1,即当前版本);4.3.0 及更高版本支持使用libcurl8 进行构建。
- 如果必须构建该版本:解决方法。
2. 配置环境
在 linux中设置环境变量一般使用bash_profile进行配置,环境变量分为两种:
/etc/bash_profile
表示系统整体设置 ,生效后系统内所有用户可用。(需要root权限)~/.bash_profile
只表示当前用户的个人设置,生效后只该用户可用。
这里只介绍配置个人环境,方法如下:
vi .bash_profile
# 按"i"可编辑,“ESC”键停止编辑,":wq"退出
export PATH="$PATH:/home/wangwz/packages/R/R-4.3.1/bin"
source .bash_profile
3. 命令
# 查看R版本
R --version
# 查看R包路径(进入R环境)
> .libPaths()
4.安装R工具包
# tidyverse镜像安装
install.packages ("tidyverse",repos="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")
# git安装
devtools::install_github('chris-mcginnis-ucsf/DoubletFinder')
标签:profile,4.3,--,工具包,Linux,packages,安装,bash
From: https://www.cnblogs.com/kingwz/p/18286150