TotallySAF+Ubuntu简要配置

一、配置环境

1、虚拟机管理器：WMware Workstation Pro 17.0

2、虚拟机：22.04.1Ubuntu

二、概述

TotallySAF is a code that estimates the cosmological parameters constraints using the Fisher formalism。简要来说就是使用Fisher矩阵来估计宇宙学参数约束的代码。出处来自Euclid望远镜模拟项目中的开发，现在已经公开，并且可以通过修改其中对于不同仪器的参数，进而得到不同望远镜或者仪器对于宇宙学参数约束的效果，从而进行进一步的研究，同时公开的代码还有FisherMathica, SOAPFish, CCCPy。可以通过不同代码对于参数的约束进行对比，得到更为精确的结果。

三、操作

现就基本的配置进行简要说明

（1）第一步，从GitHub克隆代码到本地目录

终端输入：

git clone https://github.com/syahiacherif/TotallySAF_Alpha.git

注意：前提是在虚拟机中已经配置好git才能直接使用git clone。如果没有配置可以通过在本机下载zip包然后复制到虚拟机中，使用进行解压即可。

（2）预备设置

由于该代码中make文件的特殊性，需要提前下载对应的anaconda3软件包到与文件相同的目录之下，并配置好anaconda3的环境变量

 对应的anaconda3的版本为：

当然读者也可自行修改make文件，自行尝试，这工程量有些许大。在对应的anaconda3下有该代码所需要的QT环境，无需额外配置。（避坑：我尝试过直接下载QT对应版本并且配置好之后，由于make文件的特殊性，并没有编译成果）

（3）编译代码

在TotallySAF_Alpha/QTLauncher下打开终端，输入：

make clean
 
make -project

 在编译过程中有一些警告，是正常情况，无需担心。

（4）调整代码

查看QTLauncer.pro文件是否有这一行（默认是有的），如果没有需要加上。

（5）运行

切换到TotallySAF_Alpha目录下，输入：

python launcher_linux.py

警告不影响正常计算，原因大概是在于驱动，由于代码使用的是CPU并行计算，所以需要使用的主机的资源，期间存在一些问题。如果在个人电脑中有双系统，直接在Ubuntu中运行，则不会出现该报错。

 在设置好新的相应的参数之后，点击Confirm即可，警告无影响

最后在OutPut文件夹中，有生成的输出文件：有计算photometrix galaxy clustering、weal lensing
、 cross correlation、spectroscopic galaxy clustering及其组合的一共9个矩阵文件，见名知意。需要进行绘图的话，则进行TriPlot文件夹下绘制即可。

四、结束

本文章观者多为从事天体物理、宇宙学方向的初学者，本作为个人学习记录，仅供参考，如有疑问欢迎留言。关于如何修改参数还是有点可以说的尤其是在SpecSAF中。文章很简单，操作也很简单，后续回继续更新进一步的学习。

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