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linux中awk命令从fasta中提取指定的scaffold

时间:2022-12-02 12:55:49浏览次数:50  
标签:test4 scaffold pc1 fa awk linux test root

 

001、

[root@pc1 test4]# ls
test.fa
[root@pc1 test4]# cat test.fa    ## 测试fasta文件
>mmm
11111
>bbb
888888
7777
>kkk
6666666
99999
>qqq
0000
33333
[root@pc1 test4]# awk '/>/ {p=($0 ~ "kkk")} p' test.fa
>kkk
6666666
99999
[root@pc1 test4]# awk '/>/ {p=($0 ~ "qqq")} p' test.fa   
>qqq
0000
33333

 

标签:test4,scaffold,pc1,fa,awk,linux,test,root
From: https://www.cnblogs.com/liujiaxin2018/p/16944113.html

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